Theo KTNN, từ năm 2010-2015, bằng nhiều Hợp đồng tiền gửi có kỳ hạn và các văn bản thỏa thuận, Ban Quản lý Dự án Công trình Liên hợp Lọc Hoá Dầu Nghi Sơn đã để ngoài sổ sách kế toán, Báo cáo tài chính khoản tiền lãi nhận được qua các Hợp đồng tiền gửi tại MB - Chi nhánh Thanh Hoá và Oceanbank - Chi nhánh Thanh Hóa. Số tiền để ngoài sổ sách theo rà soát ban đầu của PVN là 22,1 tỷ đồng.